Dalam proses pengkomposan, dua kelas mikroorganisma menyumbang. Set pertama mikroorganisma yang tumbuh antara 20 hingga 35ºC dipanggil mesophiles. Mesofil melakukan degradasi awal dan melakukan pengawetan kompos pada fasa akhir proses.
Mikrob mesofilik tumbuh dan membiak dengan cepat, menghasilkan haba semasa fasa awal, manakala, semasa fasa akhir pengkomposan, mereka membantu dalam kematangan bahan organik terdegradasi.
Di antara fasa pengkomposan awal dan akhir, terdapat peningkatan suhu teras campuran pengkomposan, yang dikenali sebagai fasa termofilik, di mana suhu boleh meningkat sehingga 55 hingga 70ºC.
Ini disebabkan oleh pengeluaran haba yang cepat pada fasa awal pengkomposan. Thermophiles boleh tumbuh pada suhu yang tinggi dan membantu dalam memecahkan bahan organik yang kompleks.
Suhu yang tinggi membantu dalam membunuh patogen dan rumpai. Mempunyai ekosistem mikrob adalah kunci untuk memastikan pengkomposan adalah proses pengurusan sisa pepejal yang cekap.