कंपोस्टिंग प्रक्रियेत, सूक्ष्मजीवांचे दोन वर्ग योगदान देतात. २० ते ३५ºC तापमानात वाढणाऱ्या सूक्ष्मजीवांच्या पहिल्या संचाला मेसोफाइल्स म्हणतात. मेसोफिल्स प्रक्रियेच्या अंतिम टप्प्यात प्रारंभिक निकृष्ट दर्जा पूर्ण करा आणि कंपोस्टचे उपचार करा.
मेसोफिलिक सूक्ष्मजंतू वेगाने वाढतात आणि पुनरुत्पादन करतात, सुरुवातीच्या टप्प्यात उष्णता निर्माण करतात, तर कंपोस्टिंगच्या शेवटच्या टप्प्यात ते क्षयग्रस्त सेंद्रिय पदार्थांच्या परिपक्वतेत मदत करतात.
सुरुवातीच्या आणि शेवटच्या कंपोस्टिंग टप्प्याच्या दरम्यान, कंपोस्टिंग मिश्रणाच्या कोर तापमानात वाढ होते, ज्याला थर्मोफिलिक फेज म्हणून ओळखले जाते, जेथे तापमान 55 ते 70ºC पर्यंत वाढू शकते.
हे कंपोस्टिंगच्या सुरुवातीच्या टप्प्यात जलद उष्णता उत्पादनामुळे होते. थर्मोफाइल्स इतक्या उच्च तापमानात वाढू शकतात आणि जटिल सेंद्रिय पदार्थांचे विघटन करण्यास मदत करतात.
उच्च तापमान रोगजनक आणि तण नष्ट करण्यास मदत करते. कंपोस्टिंग ही एक कार्यक्षम घनकचरा व्यवस्थापन प्रक्रिया आहे याची खात्री करण्यासाठी मायक्रोबियल इकोसिस्टम असणे महत्त्वाचे आहे.