കമ്പോസ്റ്റിംഗ് പ്രക്രിയയിൽ രണ്ട് തരം സൂക്ഷ്മാണുക്കൾ സംഭാവന നൽകുന്നു. 20 മുതൽ 35ºC വരെ വളരുന്ന സൂക്ഷ്മാണുക്കളുടെ ആദ്യ കൂട്ടത്തെ മെസോഫൈലുകൾ എന്ന് വിളിക്കുന്നു. മെസോഫിലുകൾ പ്രാരംഭ ഡീഗ്രഡേഷൻ നടത്തുകയും പ്രക്രിയയുടെ അവസാന ഘട്ടത്തിൽ കമ്പോസ്റ്റിന്റെ ക്യൂറിംഗ് നടത്തുകയും ചെയ്യുക.
മെസോഫിലിക് സൂക്ഷ്മാണുക്കൾ വേഗത്തിൽ വളരുകയും പുനരുൽപ്പാദിപ്പിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു, പ്രാരംഭ ഘട്ടത്തിൽ താപം ഉത്പാദിപ്പിക്കുന്നു, അതേസമയം കമ്പോസ്റ്റിംഗിന്റെ അവസാന ഘട്ടത്തിൽ, അവ വിഘടിച്ച ജൈവവസ്തുക്കളുടെ പക്വതയെ സഹായിക്കുന്നു.
പ്രാരംഭ, അവസാന കമ്പോസ്റ്റിംഗ് ഘട്ടങ്ങൾക്കിടയിൽ, കമ്പോസ്റ്റിംഗ് മിശ്രിതത്തിന്റെ കാതലായ താപനിലയിൽ വർദ്ധനവുണ്ടാകും, ഇതിനെ തെർമോഫിലിക് ഘട്ടം എന്നറിയപ്പെടുന്നു, ഈ സമയത്ത് താപനില 55 മുതൽ 70 ഡിഗ്രി സെൽഷ്യസ് വരെ ഉയരും.
കമ്പോസ്റ്റിംഗിന്റെ പ്രാരംഭ ഘട്ടത്തിൽ ദ്രുതഗതിയിലുള്ള താപ ഉൽപാദനം മൂലമാണ് ഇത് സംഭവിക്കുന്നത്. തെർമോഫൈലുകൾ ഉയർന്ന താപനിലയിൽ വളരുകയും സങ്കീർണ്ണമായ ജൈവവസ്തുക്കളെ വിഘടിപ്പിക്കാൻ സഹായിക്കുകയും ചെയ്യും.
ഉയർന്ന താപനില രോഗകാരികളെയും കളകളെയും കൊല്ലാൻ സഹായിക്കുന്നു. കമ്പോസ്റ്റിംഗ് കാര്യക്ഷമമായ ഒരു ഖരമാലിന്യ സംസ്കരണ പ്രക്രിയയാണെന്ന് ഉറപ്പാക്കുന്നതിന് ഒരു സൂക്ഷ്മജീവ ആവാസവ്യവസ്ഥ ഉണ്ടായിരിക്കേണ്ടത് പ്രധാനമാണ്.