In die proses van kompostering dra twee klasse mikroörganismes by. Die eerste stel mikroörganismes wat tussen 20 en 35ºC groei, word mesofiele genoem. Mesofiele voer die aanvanklike afbraak uit en doen die uitharding van kompos in die finale fase van die proses.
Die mesofiele mikrobes groei en reproduseer vinnig, en produseer hitte gedurende die aanvanklike fase, terwyl hulle tydens die finale fase van kompostering help met die rypwording van afgebreekte organiese materiaal.
Tussen die aanvanklike en finale komposteringsfase is daar 'n toename in die kerntemperatuur van die komposteringsmengsel, bekend as 'n termofiliese fase, waar die temperatuur tot 55 tot 70ºC kan styg.
Dit word veroorsaak deur vinnige hitteproduksie in die aanvanklike fase van kompostering. Termofiele kan by sulke hoë temperature groei en help om komplekse organiese materiaal af te breek.
Die hoë temperatuur help met die doodmaak van patogene en onkruid. Om 'n mikrobiese ekosisteem te hê, is die sleutel om te verseker dat kompostering 'n doeltreffende proses vir vaste afvalbestuur is.